Nature:肠道微生物代谢中间体新功能,促进HDAC3酶活性

2022-02-14 15:06:38 来源:
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灵长类动物细菌和对其有益的常与细菌的共同变异引发了细菌-细菌人关系的发展。各部位DNA修饰使得灵长类动物蛋白能够整合外界环境回波,作出贡献蛋白对环境的适应性。但是一直以来常与的肾脏细菌来源不明的多种回波通路和多种环境回波是如何精密调控的还不甚为可信。

肾脏内皮位于细菌群和细菌间的插件,作出贡献不可或缺屏障的形成,在有益一时期和损害一时期对肾脏内膜顺利完成补充。维持肾脏内皮分化过程中所有多种各部位DNA选择性参与其中所,其中所HDACs的传达对于肾脏稳定状态极为不可或缺。肾脏细菌来源不明的短链脂肪酸甘油盐(Butyrate)在体外抑止HDAC活性,甘油盐处理过程后的肾脏组织内皮中所HDAC活性下降。在冷藏兔中所植入产甘油盐的肾脏细菌可能会抑止肾脏内皮中所HDAC的活性。这些结果都陈述肾脏细菌来源不明的甘油盐抑止HDAC的活性。但是肾脏细菌与组抗原透选择性底物间的调控选择性是怎样的还不得而知。

全因,美国辛辛那提儿童医院医疗中所心Theresa Alenghat研究成果组在Nature月刊上发表文章 Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut,找到肾脏细菌来源不明的鸟苷氨盐能够通气肾脏内组抗原透选择性核糖体HDAC3的活性从而作出贡献肾脏内皮的修缮,道出了细菌对于肾脏细菌回波积极响应的具体选择性。

为了道出肾脏细菌衍生糖类副产物与各部位DNA回波间的人关系,编者们对野生型号以及肾脏内皮HDAC3敲除人体内中所的HDAC活性进性样品,找到野生型号对照组人体内中所的HDAC3传达短时间并且具有稳定的底物,但是肾脏内皮HDAC3敲除人体内则相反。编者们只想知道HDAC3是否是可能会抗原通气肾脏细菌引人注意的回波效用于。编者们找到HDAC1与HDAC2在肾脏内皮中所也有传达,但并不能补偿肾脏内皮中所HDAC3传达的有缺陷。而且在对冷藏兔和肾脏内皮HDAC3敲除人体内中所的肾脏内皮持续性HDAC类似物抑止剂处理过程后,找到在HDAC3敲除后其他种类的HDACs仍然具有活性。这些结果陈述肾脏细菌作出贡献内皮中所HDAC3在短时间肾脏稳定状态中所的底物。

为了破译肾脏细菌激活HDAC3的具体选择性,编者们对冷藏兔和短时间培养的人体内中所肾脏内皮中所的磷酸化谱顺利完成二阶。编者们找到在肾脏细菌存有的内皮中所与鸟苷氨糖类相关的DNA被广泛效用于传达。不足之处的研究成果找到鸟苷三氨(Inositol trisphosphate)可能会通过强化HDAC3与激活抗原的相互效用来降低HDAC3的活性。编者们找到外加鸟苷三氨的确可能会抗原降低HDAC3-NcoR重组抗原的活性,NcoR抗原对于HDAC3的透选择性底物极为不可或缺。

进一步地,编者们只想知道冷藏兔与对照组的人体内肾脏间鸟苷三氨程度是否是存有关联。编者们找到对照组人体内中所无论是肠腔还是肾脏内皮中所鸟苷三氨的程度都相比较高于冷藏兔,陈述肾脏细菌的存有作出贡献鸟苷三氨程度的降低。为了风险评估鸟苷三氨对于肾脏内皮中所HDAC3活性的受到影响,编者们对肾脏内皮中所的HDAC3抗原顺利完成纯化并与鸟苷三氨顺利完成共同孵育,找到鸟苷三氨的确能够降低内源HDAC3的活性。而且甘油酮造成的HDAC3活性的抑止也可以被鸟苷三氨所拮抗。另外,编者们还找到常与的肾脏细菌可能会通过鸟苷六氨(Phytate)糖类都能作出贡献肾脏内皮中所的HDAC3的系统。与鸟苷三氨相似,鸟苷六氨也可能会效用于肾脏内皮中所的HDAC3的活性。

为了样品肾脏细菌鸟苷六氨依赖的糖类对于HDAC活性的受到影响,编者们对定植野生型号以及鸟苷六氨核糖体有缺陷型号细菌的人体内顺利完成分析。编者们找到定植鸟苷六氨核糖体短时间传达细菌的人体内相比较于冷藏兔以及鸟苷六氨有缺陷型号细菌人体内的鸟苷三氨程度升高。对人体内顺利完成右旋糖酐酮钠(Dextran sodium sulfate, DSS)处理过程后,可能会效用于人体内诱发肾脏结核病。为了样品鸟苷三氨在DSS处理过程效用于的肾脏结核病中所的效用,编者们对冷藏兔持续性鸟苷三氨后找到鸟苷三氨能够作出贡献肾脏从结核病中所完全恢复并降低冷藏兔的寿命。DSS效用于的肠癌类似于产妇中所溃疡性肠癌。为了进一步确认肾脏细菌糖类副产物的系统,编者们对生命体整合细菌组学计划(Integrative Human Microbiome Project)中所的有益样本以及溃疡性肠癌高血压的样品顺利完成样品,找到在溃疡性肠癌产妇肾脏中所鸟苷六氨核糖体的丰度远低于有益样本里头所,陈述鸟苷六氨对于肾脏损害修缮是不必的。

总的来说,Alenghat研究成果组的工作找到相比较于冷藏兔,肾脏细菌存有的人体内中所HDAC3活性相比较更高,这一更高是通过常与的肾脏细菌比如细菌鸟苷六氨以及鸟苷三氨的糖类形成的。另外,鸟苷三氨可能会效用于产妇来源不明的肾脏类循环系统的土壤、刺激HDAC3依赖的增殖以及拮抗甘油酮引起的肾脏土壤抑止,可能会作出贡献肾脏结核病中所内皮的修缮。因此,编者们鉴定找到了HDAC3作为细菌积极响应多种肾脏细菌回波的为中所心各部位DNA因子的关键性系统,道出了肾脏细菌、各部位DNA因子以及细菌糖类副产物在肾脏内膜以及肾脏结核病中所的关键性调控和修缮效用。

许多现代出处:

Shu-En Wu, Seika Hashimoto-Hill, Vivienne Woo, et al.Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut.Nature. 2020 Jul 30. doi: 10.1038/s41586-020-2604-2.

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